Thiago Mendes ingressou no OL em 3 de julho de 2019 por 25 milhões de euros proveniente do Lille. Ele assinou um contrato de 4 anos com o Lyon. Com os Dogues, ele teve uma boa primeira temporada antes de explodir na segunda, em que provou ser um dos melhores meio-campistas da Ligue 1. Vice-campeão do PSG com o LOSC na temporada 2018 - Ligue 1 2019, Thiago Mendes veio ao Lyon para dar um passo à frente em sua carreira e jogar suas primeiras partidas na Liga dos Campeões.